Copenhagen Flute Connection's repetoire har som udgangspunkt den brasilianske musik i videre forstand; og med ensemblets unikke klanglige univers (fire fløjter, fra piccolo til bas) udforskes melodi, rytme og improvisation; også med referencer til jazz, salsa og "ny musik".

Gennem tiderne har fløjten spillet en væsentlig rolle i brasiliansk musik som Villa-Lobos, Pascoal, Gismonti og en stor del af populær-musikken, og det er derfor muligt for C.F.C. at præsentere et stort og varieret program, dels af original-kompositioner (Celso Mendes, Nene, Marc Steckar, Simon Spang-Hanssen), dels af arrangementer af mere eller mindre kendte "standards" A.C. Jobim, Ary Barbosa etc., med rødder i stilarter/rytmer som: samba, bossa-nova, frevo, baiâo, maracatû...

Lejlighedsvis udvides kvartetten med Afonso Correa´s percussion, som accentuerer det rytmiske element i ensemblet´s musik.